Nhóm Alfa. Đây là cánh quân sự của SBU. Đơn vị này được thành lập bởi Sắc lệnh tổng thống vào ngày 23/6/1994. Mỗi khu vực có một đội ngũ do Nhóm Alfa triển khai nhằm hỗ trợ trong thời gian các địa phương xảy ra khủng hoảng.
Nhóm Alfa có nhiều chức năng hoạt động, gồm: chặn đứng các cuộc tấn công khủng bố; giải cứu con tin; chống các nhóm vũ trang bất hợp pháp, các tổ chức khủng bố cùng các tổ chức tình báo và phá hoại của nước ngoài; đảm bảo các hoạt động tìm kiếm, điều tra, phản gián và hành động theo thủ tục của SBU; bảo vệ các cơ quan và quan chức chính phủ; bảo vệ nhân viên SBU, bộ Cảnh vệ nhà nước và thân nhân của họ; bảo vệ thẩm phán và nhân chứng trong các vụ án cấp cao; yểm trợ thiết quân luật hoặc tình trạng khẩn cấp.
Các thành viên Nhóm Alfa được đào tạo đa chiến thuật, gồm các chiến thuật đơn vị nhỏ, đào tạo vũ khí, lái xe tấn công, chọc thủng (phòng tuyến địch), nhảy dù, lặn, trèo thang dây. Các khóa tuyển chọn tân binh của Nhóm Alfa thường kéo dài vài tuần với tỷ lệ chọi 1/15 (7%).
Trung tâm chống khủng bố. Đơn vị này được thành lập vào tháng 12/1998 nhằm đối phó với đà gia tăng khủng bố trên toàn cầu. Kể từ năm 2016, trung tâm này đã xây dựng các mức độ mã màu sắc về các mối đe dọa của hoạt động khủng bố trong biên giới quốc gia. Hệ thống hiển thị mức độ đe dọa bằng 4 màu xám, xanh nước biển, vàng, và đỏ. Các mức độ đe dọa hiển thị màu ở Ukraine hiện nay là Đỏ (đe dọa thực sự): các khu vực Donetsk và Luhansk; Vàng (đe dọa dự kiến): các khu vực Zaporizzhya, Mykolaiv, Odessa, Sumy, Kharkiv, Kherson và Chernihiv; Xanh nước biển (đe dọa tiềm năng): thành phố Kyiv, Kyiv, Dnipropetrovsk, Zakarpattia, Rivne, Khmelnytskyi, khu vực Cherkasy và Chernivtsi; Xám (đe dọa có thể xảy ra): các khu vực Vinnytsia, Volyn, Zhytomyr, Ivano-Frankivsk, Kirovohrad, Lviv, Poltava và Ternopil. Năm 2020, trung tâm chống khủng bố đã tiến hành hơn 600 cuộc diễn tập huấn luyện.
Trung tâm tình huống an ninh mạng. Các chuyên gia mạng từ SBU đã làm việc 24/7 để bảo vệ Ukraine thoát khỏi nguy cơ tấn công mạng. Trung tâm tình huống an ninh mạng Ukraine đang hợp tác với các cơ quan tình báo nước ngoài đồng minh. Chỉ riêng trong năm 2019, trung tâm này đã ngăn ngừa gần 1.000 cuộc tấn công mạng nhắm vào các cơ sở hạ tầng quan trọng của Ukraine.